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伯豪生物
龍行龘龘 |935K 甲基化芯片福利來襲
發布時間:2024-02-21 瀏覽次數:5109
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935K 甲(jia)(jia)基(ji)(ji)化芯片(pian)(Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip)是一(yi)種(zhong)全基(ji)(ji)因組甲(jia)(jia)基(ji)(ji)化篩選工具(ju)(ju),靶向人類(lei)甲(jia)(jia)基(ji)(ji)化組最具(ju)(ju)生(sheng)物學意義(yi)的(de)區域中超過 935,000 個 CpG 位(wei)點,同時(shi)在其(qi)前代(dai)產品 Methylation EPIC v1.0(850K)的(de)基(ji)(ji)礎上極大的(de)提高了(le)向后兼容(rong)性(xing)。該芯片(pian)保(bao)留(liu)了(le)以單(dan)核苷酸分(fen)辨率定量分(fen)析(xi)全基(ji)(ji)因組 CpG 的(de)能力,同時(shi)提供(gong)高度準確和(he)精(jing)確的(de)甲(jia)(jia)基(ji)(ji)化測(ce)量,不(bu)受測(ce)序(xu)深度的(de)影(ying)響(xiang)。可(ke)(ke)使(shi)用精(jing)簡、用戶友好(hao)的(de) Infinium 甲(jia)(jia)基(ji)(ji)化檢測(ce)分(fen)析(xi)多(duo)種(zhong) DNA 樣(yang)本(ben)(ben)(ben)類(lei)型,包括從 FFPE 分(fen)離的(de) DNA 樣(yang)本(ben)(ben)(ben)。與其(qi)他方(fang)法相比,Methylation EPIC v2.0 具(ju)(ju)有可(ke)(ke)擴展(zhan)性(xing)和(he)更低(di)的(de)單(dan)個樣(yang)本(ben)(ben)(ben)總成(cheng)本(ben)(ben)(ben),因此可(ke)(ke)用于(yu)探究(jiu)疾病機制(zhi)和(he)生(sheng)物標志物的(de)篩選。


活動福利

滿  50 個樣本   送 好禮   

滿  100 個樣本   更有   豪禮加送


項目周期: 自 DNA 質控合格后標(biao)準(zhun)生信(xin)分析(xi)結果(guo)發送 10 個工作日;

交付結果: 標準生信分(fen)析報告和原始數據;

DNA 要求: 常規 DNA 總(zong)量≥1ug,濃度≥50ng/μl,OD260/280 在(zai) 1.8 左(zuo)右;不得(de)有(you)其(qi)(qi)它(ta)個體(ti)或(huo)其(qi)(qi)它(ta)物種的 DNA 或(huo) RNA 污染;溶解在(zai) H20 或(huo) TE (pH 8.0),特殊樣本視具體(ti)情(qing)況實驗。

活動時間:2024 年 2 月 18 日(ri)至 2024 年 5 月 31 日(ri)

活動說明:

1、合同雙方簽訂完成時(shi)間必須在(zai)活動時(shi)間內;

2、單次送樣數(shu)目為 8 的倍數(shu);

3、活動最終(zhong)解釋權歸伯豪生物所有。


935K 芯片優勢

  • 全面的基因組覆蓋范圍: 檢測 > 935,000 個 CpG 位點,全面覆蓋 CpG 島、啟動子、編碼區及增強子。

  • 探針位點的全面優化: 在 EPICv1.0-850K 的基礎上去除了性能不佳的探針,新增 186,000 個 CpG 靶向增強子和超級增強子、更多 CTCF 結合位點、CNV 檢測區域、EPIC v1.0 覆蓋不足的 CpG 島以及常見癌癥驅動突變。

  • 兼容多種樣本類型: 包括 FFPE、新鮮 / 冷凍組織、全血、口腔細胞、cfDNA、唾液和其他樣本類型。

  • 高質量的數據: 沿用了 450K 芯片的 Infinium 技術,同時采用 Infinium I 及 II 探針設計,使檢測范圍最大化。

  • 分辨率高: 單堿基分辨率,可以直接檢測到發生甲基化的準確位點。

  • 可重復性高: 自身技術重復間的相關性以及與 850K 相同探針間的相關性 R2>0.99。

  • 注釋信息: 人參考基因組版本更新到 hg38,GenCode 數據庫更新到 v41 版本。


  • 935K 與 850K 芯片數據相關性

    935K 甲(jia)基化芯片檢(jian)測能夠(gou)檢(jian)測到 0.2 的(de) beta 值差(cha)異,假陽性率低于 1%,從而實現了(le)較高的(de)分析靈敏度,同時也具(ju)有極(ji)好的(de)數據可(ke)重現性。

    如下圖:

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    (A)935K 芯片技術重復相關性 R 2>0.99;

    (B)935K 芯(xin)片和 850K 的交集探針間的相(xiang)關性 R 2>0.99;

    (C)935K 芯片(pian)數據與甲(jia)基化測序(100X 測序深度)的(de)相關性 R 2>;96%。


    935K 芯片實測數據展示

    嚴格按(an)照 Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip(簡稱 935K)操(cao)作手(shou)冊完成 DNA 抽提、轉化(hua)(hua)、擴增、雜交洗脫(tuo)等,質控結(jie)果說明(ming)雜交實驗過程穩定(ding)、轉化(hua)(hua)率高(gao)、熒(ying)光信號和結(jie)合狀況良好,綜合說明(ming)實驗操(cao)作穩定(ding),可以進一步做甲基化(hua)(hua)的數(shu)據分(fen)析。

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