基于加權共表達的計算,利用平均層次聚類的模塊的劃分,模塊與性狀之間的相關性,挑選出顯著性的性狀,構建相應網絡圖,從而找到與性狀相關的核心基因。
加權基因共表達網絡分析(WGCNA)
尋找協同表達的基因模塊(module),并探索基因網絡與關注的表型之間的關聯關系,以及網絡中的核心基因。
樣本數量在 3 組以上,并且每組的樣本重復為 3 個或 3 個以上。
1、圖片文件:cluster tree,module relation 等;
2、文本文件:每個 module 的所屬基因,以及基因之間的相關性;
3、module 之間的相關性。
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