網絡圖為篩選出的核心基因之間的關系,通過圖論的方法計算出關鍵基因,并通過關鍵基因的共表達基因預測出其功能。
時間序列的共表達網絡介紹
根據基(ji)因表(biao)(biao)達信(xin)號值隨著時間序列的變化(hua),計算基(ji)因間的共表(biao)(biao)達關系(xi),得(de)(de)到基(ji)因間的表(biao)(biao)達調控(kong)(kong)關系(xi)及調控(kong)(kong)方向(xiang),從(cong)而(er)構建基(ji)因的表(biao)(biao)達調控(kong)(kong)網(wang)(wang)絡。利(li)用此(ci)網(wang)(wang)絡圖,研究者可通過(guo)分析基(ji)因調控(kong)(kong)能(neng)力,獲得(de)(de)樣本在時間過(guo)程中起調控(kong)(kong)作用的基(ji)因。
時間,濃度,邏輯變化的樣本的差異基因,趨勢分析篩選的基因或關注的基因。
1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;
2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開進行細節調整;
3、文本文件:基因之間共表達相關性以及顯著性,基因核心共表達的排序。
-END-