英文題目(mu)：A composite single-nucleotide polymorphism prediction signature for extranodal natural killer/T-cell lymphoma

發表期刊：Blood（IF 17.543）

 通訊(xun)作者：中(zhong)山大學腫瘤防(fang)治中(zhong)心內科蔡清清教(jiao)授

DOI：10.1182/blood.2020010637

2021 年 3 月 16 日(ri)，中(zhong)山(shan)大學腫(zhong)瘤(liu)防治中(zhong)心內科蔡清清教(jiao)授課題(ti)組在(zai)國際血液(ye)學期刊 Blood 上發表了(le)題(ti)為：“A composite single-nucleotide polymorphism prediction signature for extranodal natural killer/T-cell lymphoma”的(de)(de)(de)文章(zhang)。蔡清清教(jiao)授為通訊作(zuo)者(zhe)，中(zhong)山(shan)大學腫(zhong)瘤(liu)防治中(zhong)心田小(xiao)朋副研(yan)(yan)究員、馬淑云博(bo)士，美國杜(du)克大學 Ken H. Young 教(jiao)授，新加(jia)坡國立癌癥中(zhong)心 Choon Kiat Ong 教(jiao)授，廣東省人民醫院劉艷輝(hui)教(jiao)授為共同第一(yi)作(zuo)者(zhe)。該(gai)國際回(hui)(hui)顧性(xing)多(duo)中(zhong)心隊列(lie)研(yan)(yan)究首(shou)先使用(yong)高通量 SNP 芯(xin)片（Illumina ASA，由伯豪生物(wu)提(ti)供服務(wu)）鑒定出與生存相關的(de)(de)(de) 36 個(ge)(ge) SNP 位點。進一(yi)步采用(yong) LASSO 回(hui)(hui)歸模(mo)型構建了(le)一(yi)個(ge)(ge)基(ji)于 7 個(ge)(ge) SNP 的(de)(de)(de)預測(ce)模(mo)型。創建的(de)(de)(de) ENKTL 單核苷(gan)酸多(duo)態(tai)性(xing)（Signal nucleotide polymorphism, SNP) 預后(hou)評價系統修(xiu)正了(le)腫(zhong)瘤(liu)異質(zhi)性(xing)及(ji)活檢取(qu)材部位的(de)(de)(de)偏差，作(zuo)為有效工(gong)具個(ge)(ge)體化預測(ce) ENKTL 患者(zhe)預后(hou)，可(ke)用(yong)于指導早期高危(wei)患者(zhe)接受聯合放化療(liao)。該(gai)評價系統可(ke)為不(bu)同預后(hou)風(feng)險(xian)的(de)(de)(de) ENKTL 患者(zhe)指導精(jing)準治療(liao)決策。

摘要：當(dang)前(qian)基于(yu)(yu)(yu)臨床病理變量的(de)(de)(de)(de)(de)預(yu)后(hou)評(ping)(ping)分(fen)(fen)系統(tong)不足以(yi)預(yu)測(ce)(ce)接(jie)受非蒽環類(lei)(lei)藥物治(zhi)(zhi)療的(de)(de)(de)(de)(de)結外(wai)鼻型 NK/ T 細胞淋巴瘤(liu)（ENKTL）患(huan)(huan)(huan)(huan)者的(de)(de)(de)(de)(de)生存(cun)和(he)(he)治(zhi)(zhi)療反應。這項(xiang)國際回顧性多(duo)(duo)中心隊列研究(jiu)旨在(zai)(zai)(zai)構建基于(yu)(yu)(yu)單核苷酸多(duo)(duo)態性（SNP）的(de)(de)(de)(de)(de)分(fen)(fen)類(lei)(lei)器(qi)，以(yi)提(ti)高(gao)預(yu)測(ce)(ce)準確性并指導(dao)臨床決(jue)策。分(fen)(fen)析了(le)來自(zi)國際多(duo)(duo)中心的(de)(de)(de)(de)(de) 722 名(ming) ENKTL 患(huan)(huan)(huan)(huan)者的(de)(de)(de)(de)(de)數據，使用 LASSO  回歸在(zai)(zai)(zai)訓練集（n = 336）中構建了(le)基于(yu)(yu)(yu) 7 -SNP 的(de)(de)(de)(de)(de)分(fen)(fen)類(lei)(lei)器(qi)，并在(zai)(zai)(zai)內部(bu)測(ce)(ce)試集（n=144）和(he)(he)兩個(ge)(ge)外(wai)部(bu)驗證(zheng)(zheng)集（n=142; n=100）中進(jin)一步進(jin)行了(le)驗證(zheng)(zheng)。基于(yu)(yu)(yu) 7 -SNP 的(de)(de)(de)(de)(de)分(fen)(fen)類(lei)(lei)器(qi)在(zai)(zai)(zai)訓練集和(he)(he)三(san)個(ge)(ge)驗證(zheng)(zheng)集中顯(xian)示出(chu)良好的(de)(de)(de)(de)(de)預(yu)后(hou)預(yu)測(ce)(ce)功效。由(you)分(fen)(fen)類(lei)(lei)器(qi)計算(suan)的(de)(de)(de)(de)(de)高(gao)風(feng)險(xian)評(ping)(ping)分(fen)(fen)和(he)(he)低風(feng)險(xian)評(ping)(ping)分(fen)(fen)的(de)(de)(de)(de)(de)患(huan)(huan)(huan)(huan)者表現出(chu)顯(xian)著不同的(de)(de)(de)(de)(de)無(wu)進(jin)展生存(cun)期（PFS）和(he)(he)總(zong)體生存(cun)期（OS）（所有 p  <0.001）。通(tong)過多(duo)(duo)變量分(fen)(fen)析進(jin)一步證(zheng)(zheng)明了(le)基于(yu)(yu)(yu) 7 -SNP 的(de)(de)(de)(de)(de)分(fen)(fen)類(lei)(lei)器(qi)是(shi)一個(ge)(ge)獨立的(de)(de)(de)(de)(de)預(yu)后(hou)因素，其預(yu)測(ce)(ce)準確性明顯(xian)優(you)于(yu)(yu)(yu)臨床病理風(feng)險(xian)變量。基于(yu)(yu)(yu) 7 -SNP 的(de)(de)(de)(de)(de)分(fen)(fen)類(lei)(lei)器(qi)的(de)(de)(de)(de)(de)應用不受樣品類(lei)(lei)型及腫瘤(liu)異質(zhi)性的(de)(de)(de)(de)(de)影響(xiang)。值得注意(yi)的(de)(de)(de)(de)(de)是(shi)，與單純放療相比，在(zai)(zai)(zai)高(gao)風(feng)險(xian)的(de)(de)(de)(de)(de) Ann Anbor I 期患(huan)(huan)(huan)(huan)者中，化學療法(fa)聯合(he)放療的(de)(de)(de)(de)(de)顯(xian)著改善(shan)了(le) PFS 和(he)(he) OS，而在(zai)(zai)(zai)低危患(huan)(huan)(huan)(huan)者中，兩種治(zhi)(zhi)療方式之(zhi)間(jian)沒有統(tong)計學差異。由(you)分(fen)(fen)類(lei)(lei)器(qi)和(he)(he)臨床病理變量結合(he)的(de)(de)(de)(de)(de) nomogram 評(ping)(ping)分(fen)(fen)系統(tong)明顯(xian)提(ti)高(gao)了(le)預(yu)測(ce)(ce)的(de)(de)(de)(de)(de)準確性。基于(yu)(yu)(yu) 7 -SNP 的(de)(de)(de)(de)(de)分(fen)(fen)類(lei)(lei)器(qi)是(shi)對(dui) ENKTL 中現有風(feng)險(xian)分(fen)(fen)層(ceng)系統(tong)的(de)(de)(de)(de)(de)補(bu)充，這可(ke)能(neng)會對(dui) ENKTL 患(huan)(huan)(huan)(huan)者的(de)(de)(de)(de)(de)臨床決(jue)策產生重大影響(xiang)。