英文標題:Liver type 1 innate lymphoid cells develop locally via an interferon-g-dependent loop
發表期刊:Science
作者: 白璐、唐(tang)玲(ling)、Margaux Vienne、Yann Kerdiles 為共同第一作者,田志剛教(jiao)授、彭慧教(jiao)授、孫汭教(jiao)授、Eric Vivier 教(jiao)授為通訊作者
通訊作者所在單位: 中(zhong)國科學(xue)技(ji)術大(da)學(xue)
伯豪生物提供的產品或服務: 單細胞測序服務
田志(zhi)剛院士團隊通過(guo)單細(xi)胞(bao)測序技術發(fa)現(xian)一類肝(gan)源免疫(yi)(yi)細(xi)胞(bao) ILC1,ILC1 的發(fa)育依(yi)(yi)賴于(yu) IFN- γ 的調控。該(gai)研(yan)究發(fa)現(xian)了(le)免疫(yi)(yi)細(xi)胞(bao)髓外(wai)發(fa)育新途徑,為肝(gan)臟天然(ran)免疫(yi)(yi)的形成提供了(le)重要(yao)的理(li)論(lun)依(yi)(yi)據,同時證明了(le)單細(xi)胞(bao)測序技術在基(ji)礎研(yan)究中(zhong)越發(fa)重要(yao)的作(zuo)用。
本研(yan)究發現由 ILC1s 產生的(de)(de)(de)(de) IFN- γ 通過影響其(qi)原代(dai)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)的(de)(de)(de)(de)增(zeng)殖進(jin)而(er)(er)(er)促進(jin)自身發育(yu)的(de)(de)(de)(de)過程。首先,與骨(gu)髓(sui)中存在(zai)(zai)(zai) NK 祖細(xi)(xi)(xi)胞(bao)相比,肝(gan)臟中存在(zai)(zai)(zai) ILC1 祖細(xi)(xi)(xi)胞(bao)與肝(gan)臟 IFN-γ ONILC1 原位(wei)優先作用是一致的(de)(de)(de)(de)。第二,IFN- γ 積(ji)極促進(jin) silc-1(casps3) 的(de)(de)(de)(de)分(fen)(fen)化(hua),因(yin)為 LSM 細(xi)(xi)(xi)胞(bao)表達(da) IFN- γ 受體(ti),這(zhe)種信號通路在(zai)(zai)(zai)這(zhe)些(xie)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)中是活(huo)躍的(de)(de)(de)(de)。這(zhe)一發現得(de)到了(le)(le) scRNA-seq 數(shu)據的(de)(de)(de)(de)支(zhi)持,該數(shu)據揭示了(le)(le) IFN- γ 誘(you)導的(de)(de)(de)(de)基(ji)因(yin) [如干(gan)擾素調節因(yin)子 Irf1 和(he)(he)(he) Irf2、信號轉導子和(he)(he)(he)轉錄激活(huo)子 1(Stat1)、Cd44 和(he)(he)(he) β - 2 微球蛋白(bai)(B2m)] 在(zai)(zai)(zai)這(zhe)些(xie)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)中表達(da)。之后,IFN- γ 信號以 T -bet 依賴(lai)的(de)(de)(de)(de)方(fang)式促進(jin) LSM 細(xi)(xi)(xi)胞(bao)的(de)(de)(de)(de)增(zeng)殖和(he)(he)(he)分(fen)(fen)化(hua),而(er)(er)(er)不(bu)是 ilc- 1 細(xi)(xi)(xi)胞(bao)的(de)(de)(de)(de)增(zeng)殖和(he)(he)(he)分(fen)(fen)化(hua)。然而(er)(er)(er),ILC1 分(fen)(fen)泌(mi)(mi)的(de)(de)(de)(de) IFN- γ 促進(jin) ILC1 的(de)(de)(de)(de)分(fen)(fen)化(hua),而(er)(er)(er) cNK 細(xi)(xi)(xi)胞(bao)分(fen)(fen)泌(mi)(mi)的(de)(de)(de)(de) IFN- γ 不(bu)支(zhi)持 ILC1 分(fen)(fen)化(hua)的(de)(de)(de)(de)這(zhe)一觀點(dian)仍有待確定。
本研究揭(jie)示(shi)了外周造血干細(xi)胞(bao)(bao)對特(te)異(yi)性(xing)免疫細(xi)胞(bao)(bao)起(qi)源的(de)(de)貢(gong)獻以(yi)及肝(gan)臟內(nei)獨特(te)的(de)(de)區域免疫特(te)征,擴展了我們對髓外造血及淋巴細(xi)胞(bao)(bao)來源的(de)(de)認識。
本研究中單細胞測序相關研究結果
Fig. 1. scRNAseq analysis of liver LSM cells and Lin?CD122+CD49a+ cells.
Fig. 2. LSM cells expressed IFN-γ-stimulated genes. Feature plots of relative levels of Ifngr1, Ifngr2, Irf1, Irf2, Cd44, Stat1, and B2m expressions on sorted LSM cells using scRNAseq analysis.
單細胞測序不僅能夠在研究的開始階段增加學者們對生命進程的認知與理解,同樣重要的是,在實驗階段,單細胞測序取得的數據相比于傳統的實驗更具有說服力。伯豪生物愿與您共同探索生命的奧秘。
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